Markus Hansen est né à Heidelberg en Allemagne en 1963 et a grandi à Liverpool en Angleterre.
A la suite de ses études artistiques à l'Université de Reading, il assiste Joseph Beuys pour l'installation Plight. En 1986/87, il vit en Colombie auprès de la communauté indigène des Waunana dans le cadre de la poursuite de ses recherches anthropologiques sur le rôle thérapeutique et créatif du Shaman.
A son retour en Angleterre, il est d'abord exposé à la galerie Maureen Paley. Il s'installe à Paris après une résidence d'artiste à la fondation Cartier en 1992. En 2014, il revient à Londres où il vit et travaille actuellement. Il expose en France, en Allemagne, en Suisse, en Belgique, en Espagne, au Royaume-Uni, aux Etats-Unis, au Japon, en Corée-du-Sud ou encore en Australie.
Plusieurs de ses œuvres figurent dans les collections du Centre Pompidou et du Musée d'Art Moderne de Paris, ainsi qu'au Musée d'Art Moderne et Contemporain de Strasbourg.